Microscopie à rayons X pour les plantes à différentes échelles de résolution
Des chercheurs du Donald Danforth Plant Science Center de Saint-Louis (Missouri, États-Unis) ont récemment publié une étude exhaustive intitulée « La microscopie à rayons X permet l'imagerie 3D haute résolution multi-échelle des cellules, tissus et organes végétaux » dans la revue Plant Physiology . Ces travaux démontrent l'utilisation de la microscopie à rayons X pour imager des échantillons végétaux à différentes échelles de résolution en trois dimensions, notamment grâce à des flux de travail d'imagerie corrélative multimodale combinant la microscopie électronique à balayage (MEB) en série et la microscopie à rayons X (XRM), ainsi que des approches de segmentation avancées. Dragonfly Cette technique a été utilisée pour l'enregistrement de jeux de données d'imagerie multimodale et multi-échelle, pour la segmentation 3D, la visualisation et des mesures avancées. Globalement, les résultats démontrent l'immense potentiel de la microscopie à rayons X en sciences végétales.
Selon le Dr Keith Duncan, auteur principal de l'étude, « Dragonfly est notre premier choix pour l'analyse d'images 3D et multimodales. Dragonfly L'interface utilisateur est facile à gérer et j'ai pu générer des images et des animations de haute qualité dès ma première utilisation du logiciel. On utilise aussi Dragonfly Fonctionnalités d'apprentissage profond pour plusieurs de nos projets d'analyse et de segmentation d'images. Dragonfly « C’est un outil puissant qu’on a installé sur tous nos postes de travail d’imagerie, et qui est gratuit pour les utilisateurs non commerciaux comme nous. »
Présentation vidéo
Images
La microscopie à rayons X (XRM) est un outil puissant pour l'imagerie de structures délicates et complexes telles que ces fleurs d'Arabidopsis en développement. La XRM permet la visualisation des grains de pollen dans les anthères et des ovules allongés contenant les graines, ainsi que la façon dont ces structures sont positionnées les unes par rapport aux autres dans l'espace 3D au sein du complexe floral.
Publication
Keith E. Duncan, Kirk J. Czymmek, Ni Jiang, August C. Thies, Christopher N. Topp, La microscopie à rayons X permet l'imagerie 3D haute résolution multi-échelle des cellules, tissus et organes végétaux . Physiologie végétale : Volume 188, Numéro 2, février 2022, Pages 831–845 ( https://doi.org/10.1093/plphys/kiab405 ).
Centre de recherche associé
Keith E. Duncan, Kirk J. Czymmek, Ni Jiang, August C. Thies, Christopher N. Topp, La microscopie à rayons X permet l'imagerie 3D haute résolution multi-échelle des cellules, tissus et organes végétaux . Physiologie végétale : Volume 188, Numéro 2, février 2022, Pages 831–845 ( https://doi.org/10.1093/plphys/kiab405 ).